Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM1Q2NKQ1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM1Q2NKQ1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms