Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSPP1Q1MSJ5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSPP1Q1MSJ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms