Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP6V1FQ16864 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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