Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DUSP6Q16828 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP6Q16828 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms