Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF239Q16600 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF239Q16600 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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