Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDB1Q16531 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDB1Q16531 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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