Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GABRA6Q16445 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GABRA6Q16445 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GABRA6Q16445 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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GABRA6Q16445 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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GABRA6Q16445 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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GABRA6Q16445 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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GABRA6Q16445 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABRA6Q16445 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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