Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD5Q16401 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD5Q16401 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms