Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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SSX2Q16385 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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SSX2Q16385 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SSX2Q16385 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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