Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA1EQ15878 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms