Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NEDD8Q15843 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8Q15843 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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