Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NPTX1Q15818 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NPTX1Q15818 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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