Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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RYR3Q15413 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RYR3Q15413 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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RYR3Q15413 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RYR3Q15413 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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