Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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COL9A2Q14055 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COL9A2Q14055 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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COL9A2Q14055 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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COL9A2Q14055 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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COL9A2Q14055 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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COL9A2Q14055 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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COL9A2Q14055 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL9A2Q14055 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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