Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTB1Q13884 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms