Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBB3Q13509 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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TUBB3Q13509 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBB3Q13509 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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