Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAD4Q13485 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SMAD4Q13485 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD4Q13485 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD4Q13485 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMAD4Q13485 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMAD4Q13485 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMAD4Q13485 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMAD4Q13485 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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