Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FOXE3Q13461 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXE3Q13461 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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