Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
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SEMA3BQ13214 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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SEMA3BQ13214 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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SEMA3BQ13214 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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SEMA3BQ13214 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3BQ13214 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SEMA3BQ13214 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SEMA3BQ13214 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SEMA3BQ13214 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SEMA3BQ13214 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SEMA3BQ13214 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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SEMA3BQ13214 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SEMA3BQ13214 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3BQ13214 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms