Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX10Q13206 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DDX10Q13206 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms