Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPA4Q13156 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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