Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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