Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MRPL28Q13084 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MRPL28Q13084 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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