Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRDNQ13061 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRDNQ13061 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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