Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFX1Q12986 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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