Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNMA1Q12791 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNMA1Q12791 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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