Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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GTF3C1Q12789 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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GTF3C1Q12789 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C1Q12789 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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