Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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