Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ELP6Q0PNE2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms