Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
FAM27E3Q08E93 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM27E3Q08E93 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms