Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP3CAQ08209 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms