Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CKAP4Q07065 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CKAP4Q07065 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms