Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CALD1Q05682 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms