Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE3Q05541 YJR079WYJR079W 330 nt3.6□□□□□ -1.83
NSE3Q05541 YAR047CYAR047C 321 nt3.6□□□□□ -1.83
NSE3Q05541 YML084WYML084W 309 nt3.6□□□□□ -1.83
NSE3Q05541 MSB2YGR014W 3921 nt3.6□□□□□ -1.83
NSE3Q05541 APC2YLR127C 2562 nt3.59□□□□□ -1.83
NSE3Q05541 YGL165CYGL165C 579 nt3.59□□□□□ -1.83
NSE3Q05541 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.59□□□□□ -1.83
NSE3Q05541 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt3.59□□□□□ -1.83
NSE3Q05541 TEN1YLR010C 483 nt3.59□□□□□ -1.83
NSE3Q05541 ILS1YBL076C 3219 nt3.59□□□□□ -1.83
NSE3Q05541 TCP1YDR212W 1680 nt3.59□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 SOK1YDR006C 2706 nt3.58□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 RLF2YPR018W 1821 nt3.58□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 DAS1YJL149W 1992 nt3.58□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 PFK26YIL107C 2484 nt3.58□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 TPM2YIL138C 486 nt3.58□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 IRC19YLL033W 693 nt3.58□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 SLM6YBR266C 453 nt3.58□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 LEU3YLR451W 2661 nt3.58□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YAT2YER024W 2772 nt3.58□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 ROM1YGR070W 3468 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 SWF1YDR126W 1011 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 ERP6YGL002W 651 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 SPT4YGR063C 309 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YPP1YGR198W 2454 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 BAT1YHR208W 1182 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 RSE1YML049C 4086 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 ROY1YMR258C 1662 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 PEX17YNL214W 600 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 RUD3YOR216C 1455 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YOR392WYOR392W 444 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YBR285WYBR285W 435 nt3.57□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 TRM2YKR056W 1920 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 NDT80YHR124W 1884 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 BMS1YPL217C 3552 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 DSE4YNR067C 3354 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 FYV4YHR059W 393 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 GPI14YJR013W 1212 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YKL066WYKL066W 444 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YAR068WYAR068W 486 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YOL134CYOL134C 390 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 NSP1YJL041W 2472 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 SIN3YOL004W 4611 nt3.56□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 TCB2YNL087W 3537 nt3.55□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt3.55□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 VOA1YGR106C 798 nt3.55□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YKL111CYKL111C 336 nt3.55□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 URA10YMR271C 684 nt3.55□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 ESF2YNR054C 951 nt3.55□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 TSC11YER093C 4293 nt3.55□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YNL034WYNL034W 1839 nt3.55□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 ATG21YPL100W 1491 nt3.54□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 ECM5YMR176W 4236 nt3.54□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 FLO9YAL063C 3969 nt3.54□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 TIM11YDR322C-A 291 nt3.54□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YER189WYER189W 369 nt3.54□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 CRG1YHR209W 876 nt3.54□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 PEP8YJL053W 1140 nt3.54□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 BUD4YJR092W 4344 nt3.53□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 NDD1YOR372C 1665 nt3.53□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 ATP17YDR377W 306 nt3.53□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 UNG1YML021C 1080 nt3.53□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 CDC33YOL139C 642 nt3.53□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 YBR012CYBR012C 420 nt3.53□□□□□ -1.84
NSE3Q05541 AST2YER101C 1293 nt3.52□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 GLC7YER133W 939 nt3.52□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.52□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 RPL33AYPL143W 324 nt3.52□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YIL166CYIL166C 1629 nt3.52□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 BNA4YBL098W 1383 nt3.51□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 VPS64YDR200C 1815 nt3.51□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 SSY1YDR160W 2559 nt3.51□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 ADK1YDR226W 669 nt3.51□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 HPA3YEL066W 540 nt3.51□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 RTR1YER139C 681 nt3.51□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YFL065CYFL065C 309 nt3.51□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YIL058WYIL058W 285 nt3.51□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 snR13snR13 124 nt3.51□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 PMR1YGL167C 2853 nt3.51□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 IKI3YLR384C 4050 nt3.5□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 DNA2YHR164C 4569 nt3.5□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 NOP19YGR251W 591 nt3.5□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 RRF1YHR038W 693 nt3.5□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 SWM2YNR004W 441 nt3.5□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 ERP4YOR016C 624 nt3.5□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YOR385WYOR385W 873 nt3.5□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 NIC96YFR002W 2520 nt3.5□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 FUN30YAL019W 3396 nt3.49□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 PSK2YOL045W 3306 nt3.49□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 NPR3YHL023C 3441 nt3.49□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 PSY2YNL201C 2577 nt3.49□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 GPI19YDR437W 423 nt3.49□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 RPC10YHR143W-A 213 nt3.49□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YIL054WYIL054W 318 nt3.49□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 ZEO1YOL109W 342 nt3.49□□□□□ -1.85
NSE3Q05541 YPL276WYPL276W 438 nt3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 198.9 ms