Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3AQ05086 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms