Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBXN1Q04323 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms