Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCNT1Q02742 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GCNT1Q02742 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms