Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYP27A1Q02318 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms