Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC10Q01780 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms