Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1DQ01668 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNA1DQ01668 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms