Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE1BQ01064 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1BQ01064 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms