Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDK17Q00537 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK17Q00537 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms