Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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