Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NUCB2P80303 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms