Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF2IP78347 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms