Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TUBB4BP68371 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBB4BP68371 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms