Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPM4P67936 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPM4P67936 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPM4P67936 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPM4P67936 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPM4P67936 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM4P67936 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM4P67936 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPM4P67936 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPM4P67936 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPM4P67936 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms