Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERVFC1-1P60608 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms