Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP4P57796 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP4P57796 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP4P57796 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP4P57796 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP4P57796 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP4P57796 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP4P57796 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CABP4P57796 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CABP4P57796 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CABP4P57796 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CABP4P57796 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CABP4P57796 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CABP4P57796 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CABP4P57796 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms