Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBASH3AP57075 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms